Таджикистан, обладая относительно небольшой территорией, имеет достаточную и разветвленную систему особо охраняемых природных территорий (ООПТ).

Одной из важнейших функций данной системы является сохранение уникального природного, исторического и культурного наследия страны для будущих поколений и его приумножения. По состоянию на 2004 год все природоохранные территории Таджикистана занимают суммарную площадь – 3,1 млн. га. или 22% территории республики и включают в себя 4 заповедника общей площадью 173418 га, 13 заказников на площади 313260 га, 1 национальный парк общей площадью 2,6 млн. га, 1 историко-природный парк-3000 га и 1-природный парк 3805 га.
Планируется также создание некоторых природных парков на основе существующих заказников.
Система ООПТ Республики Таджикистан охватывает практически всё разнообразие природных ландшафтов. Благодаря системе ООПТ, под защиту и контроль попало около 1200 видов растений, 85 видов млекопитающих, 10 тыс. видов беспозвоночных, 44 вида пресмыкающихся, 49 видов рыб, 346 видов птиц, многие из которых имеют международное значение.
Памятники природы, занимающие незначительные площади, представлены различными уникальными объектами природы и взяты под государственную охрану. Всего в республике в настоящее время данный статус присвоен 162 объектам.
На территории ООПТ расположены многочисленные поселения, культура и устои которых сохранили исторические черты их предков. Вблизи таких поселений сохранились древние исторические и культурные памятники и ландшафты.
Таджикский Национальный Парк (ТНП).
Сегодня развитие ТНП это инновационный пример.
Таджикский Национальный Парк организован в 1992 году. Он является самой крупной особо охраняемой природной территорией республики (и Центральной Азии в целом); площадь 2,6 млн. га составляет 18% от общей площади Таджикистана, 60% территории Горно-Бадахшанской Автономной области.
Таджикский Национальный Парк к 2030 году приобретет статус биосферной территории и возможно будет включен во всемирный список наследия ЮНЕСКО. На данном этапе уже запущена процедура вступления Таджикистана в Конвенцию Всемирного Наследия через её номинацию в список Международных национальных парков.
ТНП в скором будущем станет доминирующей частью Международного Парка от Республики Таджикистан. Эта крупнейшая трансграничная инициатива, которая запущена уже сейчас совместно с заинтересованными природоохранными организациями Китая, Пакистана и Афганистана при поддержке WWF Пакистана. Международный Парк станет трансграничной ООПТ и займет территорию на стыке границ вышеуказанных стран (Ваханский коридор и сопредельные территории). Основной целью создания такого трансграничного парка станет организация эффективного сохранения и устойчивого использования редких и исчезающих видов животных, в особенности сезонно мигрирующих, а также организация экологического туризма. Впоследствии в этот парк, возможно, будут включены Кыргызстан и Индия.
Более третьей части парка будет классифицировано как особоохраняемая природная территория. Большая часть территории будет объявлена биосферной территорией ЮНЕСКО, позволяющей выполнять обоснованные формы многоцелевого рекреационного использования земель.
ТНП будет являться центром экологического и других видов туризма в Таджикистане с высокоразвитой инфраструктурой. Туристы будут приезжать на эту территорию для того, чтобы насладиться первозданной природой, отдохнуть и восстановить здоровье а местное население будет иметь улучшенные и экологически безопасные жизненные условия.
Заповедник «Тигровая балка» образован в 1938 году, общая площадь составляет 49,7 тыс. га, расположен на самом юге республики, на высоте 300-500 м. Заповедник организован с целью сохранения уникальных сообществ тугайного леса. В результате, на сравнительно значительной территории (более 24 тыс. га) сохранились тугайные леса -своеобразные джунгли Средней Азии.
К сожалению тигров, в заповеднике сохранить не удалось, однако на территории заповедника успешно сохранились такие животные как благородный бухарский олень, джейран, камышовый кот, гиена полосатая, фазан, а также обычные представители фауны этих мест.
Заповедник находится в Хатлонской области республики, к которому от города Душанбе можно доехать на автомашине за 4 часа.
По заявкам туристов на территории заповедника, по согласованию с администрацией, возможно размещение в палаточных лагерях, предоставление экскурсионного обслуживания.
Заповедник «Ромит» организован в 1959 году, общая площадь 16,2 тыс. га.
Территорию заповедника занимают скалистые и каменистые ландшафты на высоте 1176-3195 м. над уровнем моря. Одно из значительных достижений заповедника – создание искусственной популяции бухарского оленя, сохранение генофонда природных комплексов.
Заповедник расположен и в живописном Ромитском ущелье, недалеко от города Вахдат.
Заповедник находится на расстоянии более 80 километров от города Душанбе. Проезд на территорию заповедника организовывается по согласованию с администрацией на заказном транспорте. Рамитское ущелье постановлением Правительства Республики Таджикистан объявлено зоной туризма, где есть множество объектов размещения, питания и предоставления медицинских услуг.
Заповедник «Дашти Джум» организован в 1983 году на южном склоне Дарвазкого хребта, площадь 19,7 тыс. га. Целью организации стало сохранение последней на территории Центральной Азии полноценной и жизнеспособной популяции винторогого козла Мархура, а также среднеазиатского муфлона. Заповедник расположен в Шурабадском районе Хатлонской области республики, который находится в 40 километрах от города Куляба и в 240 километрах от столицы республики.
Горные массивы Шурабада представляют собой живописные лесистые холма и в отдельных участках скалистые местности.
Наиболее выраженной особенностью местности является наличие разнообразной флоры и фауны, а также уникальных ландшафтов. Особенной достопримечательностью региона является обитание здесь горных Винторогих козлов, популяция и ареал которых в мире ограничен.
Винторогий козел (Мархур) является обитателем средней полосы южных гор, где скалистые участки пересекаются с альпийскими лугами. В Дашти Джумском заповеднике большую часть года Винторогие козлы держатся в поясе арчового редколесья на высоте 1200-2400 метров над уровнем моря, зимой спускаются ниже до 800 метров. Наличие скалистых участков и глубоких коньенов (хребет Кушвористан) - необходимое условие для существования Винторогого козла. Гон у Винторогих козлов проходит тем раньше и интенсивней, чем раньше наступают холода. Обычно на территории Заповедника гон начинается в ноябре и продолжается до конца декабря. В этот период по согласованию с руководством заповедника особенно результативно можно организовывать фотоохоту для туристов любителей дикой природы.
Заповедник «Зоркуль» организован в 2000 году на площади 87,7 тыс. га, и охватывает территории Мургабского и Ишкашимского районов ГБАО. Заповедник организован с целью сохранения уникального Восточно-Памирского природного комплекса и практически последней достаточно большой гнездовой колонии горных гусей (до 700-1000 особей), которые внесены в Международную Красную книгу.
Заказники:
На территории республики организовано 13 заказников, из которых:
- 8 комплексных: «Зеравшанский», «Искандеркульский», «Нурекский», «Чильдухтаронский», «Сангворский», «Музкольский», «Окташский», «Каратауский», цель создания которых является сохранение природных комплексов, фисташкового редколесья, широколиственных лесов, бурого тяньшанского медведя, барана Северцова, популяции бухарской бурозубки, снежного барса, горного гуся, памирского архара, сибирского козерога, сурка Мензбира, зерафшанского фазана;
- 3 ботанических - «Сайвотинский», «Кусавлисайский» и «Алмасинский», которые предназначены для сохранения арчового лесного массива, восстановление запасов мест произрастания унгернии Виктора;
- 2 зоологических - «Дашти Джумский» и «Комароуский», предназначенные для предотвращения уничтожения последней популяции винторого козла «Мархура», охраны бурого тяньшанского медведя и снижения фактора антропогенного беспокойства, браконьерства, прекращения выпаса скота и т.д.
Общая территория заказников занимает площадь 31326 га, что составляет 3,5% территории республики.
Самым большим является «Музкольский» заказник - 66,9 тыс. га. - на Памире, а самым маленьким - «Зеравшанский», 2,3 тыс. га. в Фанских горах.
Целями создания заказников также являются сохранение и воспроизводство природных ресурсов, охрана уникальных естественных ландшафтов, рекреационных территорий и памятников природы.
Другие парки:
1. Историко-природный парк «Ширкент»- расположен близ города Турсунзаде Республики Таджикистан, на расстоянии более 70 километров от столицы республики. Парк располагает уникальными природно–рекреационными ресурсами и весьма благоприятен для организации горно-спортивных туров. Заезд на территорию осуществляется по заявкам на заказном транспорте.
2. Природный парк «Сари-Хосор»- расположен в Бальджуванском районе республики, который решением Правительства Республики Таджикистан объявлен зоной международного туризма. Парк находится на расстоянии более 300 километрах от города Душанбе, куда можно доехать на заказном транспорте по согласованию с администрацией.